提高化肥利用率的作用
微生物肥料在解決化肥利用率低方面有獨(dú)到的作用。根據(jù)中國作物種類和土壤條件，采用微生物肥料與化肥配合施用，既能保證增產(chǎn)，又減少了化肥使用量，降低成本，同時(shí)還能改善土壤及作物品質(zhì)，減少污染。
在綠色食品生產(chǎn)中的作用
隨著人民生活水平的不斷提高，尤其是人們對(duì)生活質(zhì)量提高的要求，全球都在積極發(fā)展綠色農(nóng)業(yè)（生態(tài)有機(jī)農(nóng)業(yè)），生產(chǎn)安全、無公害的綠色食品。近年來，很多地方開始使用具有特殊功能的菌種制成多種微生物肥料，不但能緩和或減少農(nóng)產(chǎn)品污染，而且能夠改善農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)。
微生物肥料在環(huán)保中的作用
利用微生物的特定功能分解發(fā)酵城市生活垃圾及農(nóng)牧業(yè)廢棄物而制成微生物肥料是一條經(jīng)濟(jì)可行的有效途徑。目前已應(yīng)用的主要是兩種方法：
（1）將大量的城市生活垃圾作為原料經(jīng)處理由工廠直接加工成微生物有機(jī)復(fù)合肥料。
（2）工廠生產(chǎn)特制微生物肥料（菌種劑）供應(yīng)堆肥廠（場(chǎng)），再對(duì)各種農(nóng)牧業(yè)物料進(jìn)行堆制，以加快其發(fā)酵過程，縮短堆肥的周期，同時(shí)還提高堆肥質(zhì)量及成熟度。
改良土壤作用
微生物肥料中有益微生物能產(chǎn)生糖類物質(zhì)，占土壤有機(jī)質(zhì)的0.1%，與植物粘液，礦物胚體和有機(jī)膠體結(jié)合在一起，可以改善土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，增強(qiáng)土壤的物理性能和減少土壤顆粒的損失，有利于提高土壤肥力。
